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发酵罐已灭菌部分于未灭菌部分之间不得直接连通，防止细菌繁殖进入尽量减少法兰连接，以免法兰连接处因设备振动和热膨胀移位而导致污染防止形成死角、裂缝等，这些地方容易藏有不被热破坏的污染菌部分结构可单独灭菌与发酵罐相通的然后活动连接都应利用蒸汽进行密封所有阀门应易于清洗、维修和灭菌发酵罐结构应能够始终保持正压，以防止向罐内渗漏发酵罐使用不锈钢制造，小于30L的小型发酵罐可用玻璃制造通风发酵附属设备空气除菌设备消泡装置发酵罐的冷却装置空气除菌装置过滤除菌原理：微生物微粒在随气流通过滤层时，在改变运动速度和运动方向。

1.绕过纤 维前进的过程中，将因滤层行为产生惯性冲击、阻拦、重力沉降、布朗扩散、静电吸引等作用而把微粒滞留在纤维表面典型空气过滤除菌流程：环境污染比较严重的地方要改变吸风的条件，以降低过滤器的 负荷，提高空气的无菌程度。温暖潮湿的地方要加强除水措施以确保和发挥过滤器的最大除菌效率。

2.在压缩机耗油严重的设备流程中则要强调消除油雾的污染等最简单，适合于气候寒冷，相对湿度很低的地区或季节使用比较完善的空气除菌流程，能充分分离油水，使空气达到低的相对湿度后进入过滤器， 提高过滤效率，可适应各种气候条件，尤其适用于潮湿的南方地区消泡装置形成原因：微生物的菌体代谢过程产生的气体聚结而成，通入的空气被搅拌器打散而成；与培养液的固形物性质有关，含蛋白质高的原料易产生泡沫，含糊精、糖蜜多的发酵液。